19 июля 2024 года после Литургии в день Собора Радонежских святых Митрополит Таллинский и всея Эстонии Евгений освятил расположенное с северной стороны от собора кладбище и обновленное надгробие на могиле монаха Климента (Константина Николаевича Леонтьева).
На некрополе с северной стороны собора в честь иконы Божией Матери Черниговской Гефсиманской находятся захоронения братии, благотворителей и попечителей. Лишь недавно, усилиями неравнодушных к делу восстановления памяти о предках историков удалось составить списки погребенных в Гефсиманском скиту, в его Пещерном отделении и в Боголюбской киновии. С 1859 по 1922 год на кладбище Пещерного отделения (близ Черниговского собора) было погребено 113 усопших. В документах 1916-1917 годов отмечены погребения духовных и светских лиц из Минской и Гродненской губерний, которые являлись беженцами духовного звания с семьями из областей Белоруссии оккупированной германской армией.
С севера от Черниговского собора расположены захоронения двух знаменитых русских философов и публицистов – Константина Николаевича Леонтьева (1831-91 гг.), принявшего монашество с именем Климент, и Василия Василиевича Розанова (1856-1918 гг.).
Константин Николаевич Леонтьев – русский дипломат, публицист, философ. Во время своих трудов в российской дипслужбе на Ближнем Востоке он побывал на Афоне, познакомился со старцами Иеронимом и Макарием. В 1873-87 гг., по возвращении в Россию, занимался публицистикой. В 1887 г. окончательно поселился в Оптиной пустыни, где находился под старческим руководством прп. Амвросия Оптинского.
Предвидя по дару прозорливости свою кончину, преподобный Амвросий благословил Леонтьева принять монашеский постриг, покинуть окрестности Оптиной пустыни и поселиться вблизи Черниговского скита, поступив под наставничество иеромонаха Варнавы Гефсиманского. Вскоре после пострижения монах Климент заболел и скоропостижно скончался. По Промыслу Божию преподобный Варнава, чью память мы чтим 19 июля, принял у него последнюю исповедь.
Летом 2024 года на кладбище прошли работы по благоустройству: выложена дорожка, обустроены новые зеленые насаждения. Над могилой монаха Климента установлено новое надгробие.
Изначально на этом месте был памятник, освященный 28 декабря 1893 года (9 января 1894 года – по новому стилю). Памятник тот был сооружен на средства сослуживцев и почитателей памяти почившего и имел форму часовни из чугуна, увенчанной позолоченной главой с крестом. Как и весь некрополь, он был порушен в годы духовного запустения. О месте погребения можно было узнать только из дневниковых записей писателя Пришвина, который присутствовал при погребении философа Розанова, чью могилу расположили рядом с местом упокоения монаха Климента. Место погребения было вновь обретено 3 октября 1991 г., незадолго до 100-летия со дня преставления.